En 2005 Zamartze pasa a ser la casa de espiritualidad de la diócesis de Pamplona-Tudela.
Entre los años 2010-2016 se realizan las excavaciones en Zamartze a cargo de Aditu y la universidad de Oxford. En estas excavaciones se realizan un total de 330 exhumaciones medievales. Se descubre una calle porticada del S.III y se realiza el descubrimiento de una calzada romana del S.I.
Actualmente el monasterio de Zamartze se ha convertido en un punto de referencia tanto espiritual como artístico e histórico.